Le conseil général du Doubs, dans sa séance du 28 août 1845 fait mention de l'Oeuvre de Saint Joseph : " Appréciant l'utilité de la société formée à Besançon sous le titre de Saint Joseph, pour l'apprentissage des jeunes garçons, et l'avantage résultant pour le département de lui confier les enfants pauvres qui seraient dans le cas d’être admis à Bellevaux , le Conseil vote en faveur de cette société, au budget de 1846, chapitre 21, article 2, une allocation de 1,500 francs. "
En 1883, l’Archevêque de Besançon décide de créer une Ecole Primaire Supérieure. Il la confie aux frères des Ecoles Chrétiennes. L'Institution Saint Joseph s'installe alors dans la boucle, rue Pasteur.
En 1936, l’Institution rachète l’usine d'automobiles Th. Schneider, 28 avenue Fontaine-Argent,. Elle y fait construire un lycée capable d’accueillir les 325 élèves qui sont à l’étroit dans les bâtiments de la rue Pasteur, dont le directeurest le chanoine Jasquard. Démolition, reconstruction, le chantier débute en novembre 1937, la première pierre sera posée le 19 mars 1938, le jour de la Saint Joseph. Il s’agissait de construire devant l’usine un nouveau bâtiment dédié à la Direction, l'enseignement général, l'internat et la restauration. Les ateliers seront implantés dans la partie d'usine conservée, caractérisée par ses toits dits en shed, c’est à dire en dents de scie.
L’architecte d'origine jurassienne René TOURNIER installé à Besançon en 1931 conçoit les plans du nouveau bâtiment. Ce bâtiment, que l’on peut toujours admirer aujourd’hui, est construit en pierre, mais toutes les ouvertures sont soulignées par des briques.
Le lycée, achevé en 1939. Le 18 mars 1939, en préliminaire d'un article de La Croix traitant de l'enseignement libre, Mgr Dubourg "... constatant que l'année 1939 sera marquée dans le diocèse de Besançon par le centenaire de l'Institution Saint-Jean et l'inauguration de l'Institution Saint-Joseph, attire l'attention de ses diocésains sur l'importance de l'enseignement libre ..." Le lycée est très vite réquisitionné par l'Armée Française, puis par les Allemands. Le 30 janvier 1945 : Déclaration à la préfecture du Doubs.- Association AVANT-GARDE DE SAINT-JOSEPH. But: pratique du football, basket-ball. volley-ball, hand-ba'l, athlétisme. Siège social: institution Saint-Joseph, 8, rue Pasteur. Besancon [JO 15 février 1945]. En 1946 300 élèves font leur rentrée sous la direction du Chanoine Gaston Barisien, ex-professeur au Grand Séminaire, le Chanoine a été détenu plusieurs années dans un stalag allemand. Le chef d'orchestre était détenu dans le même stalag.
En 1960 les effectifs atteignent 550 élèves, l’internat est trop petit, les plus jeunes vont donc dormir chez les Bons Pères Capucins rue de la Cassotte et les grands au grand séminaire rue Mégevand.
Dans les années 50-60, l'établissement ne dispose pas de Gymnase :
Nous avons fréquenté la même école primaire rue Pasteur, puis Grand'rue et le même lycée jusqu'en 3°. Notre dernière classe ensemble est la 5°, à cette époque là, un soir par semaine nous avions une séance de travail manuel. Sur l'image ci-contre l'un des établis où Jean Pierre a transpiré.
Il a démaré sa carrière à la Trésorerie Générale de Besançon, puis à regagné l'Ile de France. Là, il a fréquenté des artistes très connus qui l'étaient peu à cette époque là.
Il a joué au théâtre, il a tourné dans de nombreux films :